NGS, Proteômica e Programas de Interações

 Uso de NGS e Análises Proteômicas em Tratamentos Recomendados por  Softwares de Interações Medicamentosas e inovações, usados em 2000 pacientes com diversos tipos de câncer

Sodré Neto 

Resumo : Diversos fármacos, fitoterápicos, alimentos nutracêuticos e múltiplos protocolos anticâncer (incluindo radioterapia)  tem demonstrado seus percentuais de sucesso nas fases pré-clínicas e clínicas. A resposta em cada tipo de câncer , em cada organismo e em cada circunstância multifatorial,   tem sido diferenciada, impedindo assim, caso tenha muitas opções,  uma decisão mais acertada sobre qual caminho tomar, requerendo análise de muitos especialistas que vem sendo substituídos (devido a inviabilidade de acesso a todos) por softwares de interação medicamentosa os quais tem auxiliado milhares de tratamentos.  Depois de uma análise nestes termos,  buscamos neste estudo caracterizar com ênfase em testes  NGS e proteômica , qual abordagem indicada e eleita,  tem mais eficácia para qual genotipo e aspecto proteômico manifestado.

O câncer como uma doença multifatorial reclama medidas também multifatoriais que o abordem por completo e não apenas na ponta do processo oncogênico. Na literatura temos especifidades no tratamento que por melhores que sejam,  diante das comorbidades,  acabam por negligenciar diversos aspectos conjuntos que precisariam ser tratados até mesmo para aumentar a qualidade de vida do paciente, eliminar causas,  aumentar  o potencial do tratamento principal,  otimizar esforços para redução de tempo de tratamento, aumentar a sobrevida e diminuir recidivas . Para isto,  propomos uma fase clínica com 2000 pacientes que recebam um coquetel de abordagens monitoradas por softwares de interações medicamentosas, associados a exames de NGS e testes de proteínas,  os quais permitem acompanhamento em tempo hábil para monitorar cada abordagem farmacológica,  nutracêutica e fitoterápica, quimioterápica e radioterápica, imunoterápica, psicoterapêutica, ozonioterápicas, crioterápicas, geoterápicas, hidroterapicas e fisioterapêuticas, bem como outras relacionadas que podem ser sugeridas durante o estudo.

O câncer pode ser abordado no mínimo sob  três perspectivas:

1. Induzindo a apoptose
2. Atacando a célula
3. Criando comunicações inter-celulares que corrijam a célula danificada 


NGS e Proteoma como testes de acompanhamento 

O sequenciamento de última geração (NGS) é uma metodologia de alto rendimento que permite o rápido sequenciamento dos pares de bases em amostras de DNA ou RNA. Suportando uma ampla gama de aplicações, incluindo perfis de expressão gênica, contagem de cromossomos, detecção de alterações epigenéticas e análise molecular, a NGS está impulsionando a descoberta e possibilitando o futuro da medicina personalizada.https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/sequencing/next-generation-sequencing.html

Proteoma é o conjunto de proteínas expressas em resposta a definidas condições ambientais ou temporais de um sistema.

A tecnologia PTMScan pode ser usada para:

• Determinar novos sítios de proteínas que são fosforilados, ubiquitinados, acilados, metilados ou protease clivados.
• Identifique e valide alvos de drogas.
• Descubra biomarcadores.
• Explore o mecanismo de ação de drogas / moduladores químicos.
• Elucidar efeitos de drogas fora do alvo.
  
  https://www.cellsignal.com/common/content/content.jsp?id=proteomics-kits

Imunoterapia 


* Foi utilizada, a combinação de oligodesoxinucleótidos enriquecidos com CG não metilado (CpG) que induz uma resposta imune em um curto trecho de DNA chamado de oligonucleotídeo CpG, trabalhando com outras células imunes próximas para amplificar a expressão de um receptor ativador chamado OX40 na superfície das células T. O outro agente, um anticorpo que se liga ao OX40, ativa as células T para atuar contra as células cancerígenas. https://med.stanford.edu/news/all-news/2018/01/cancer-vaccine-eliminates-tumors-in-mice.html

1. O efeito placebo que é reconhecido e demonstrado na literatura científica por poder curar a pessoa. Células T comandam nosso sistema imunológico (Anne) e recebem ordens dos neurônios. (Ver Publicações sobre influência da mente no câncer https://faculty.mdanderson.org/profiles/lorenzo_cohen.html ).

2. Os alimentos e plantas nutracêuticos junto com mudança de estilo de vida ( Mutos artigos científicos, destaco grandes oncologistas desta linha como Ornish, Richad Beliveau, Denis Gringas, etc e tal

3. As medidas convencionais da radioterapia, quimioterapia e cirurgias (sobretudo as menos invasivas
3.1 Radioterapias mais precisas efetuados por equipamentos mais modernos
3.2 Quimioterapias mais modernas que atacam com maior especificidades células alvo
3.3 Cirurgias menos arriscadas ou menos invasivas como laser

4. Imunoterapias e vacinas como este sistema que saiu agora que custa 475 mil dólares onde pega a linfa junto com as células alvo, a educa, sinaliza,  depois a multiplica e retorna a linfa da pessoa. https://www.publico.pt/2017/08/30/ciencia/noticia/aprovada-primeira-terapia-genetica-para-tratar-a-leucemia-nos-eua-1783907/amp

5. Fármacos e Associações 

1. EXISTEM DIETAS QUE COMBATEM O CÂNCER ? SIM OU NÃO ?

Sim existem!  E os oncologistas entrevistados pela TV record ao criticarem o douto cientista Dr. Lair Ribeiro por ocasião da morte do reporter Marcelo Rezende, demonstraram total falta de atualizações sobre pesquisa do câncer , pois mesmo sendo especialistas em oncologia, acabaram por confirmar outra fala do Dr. Lair alegando que o curso de medicina não aprofunda quase nada em nutrição e conversando com uma oncologista ela me revelou que esta especialização em oncologia praticamente só ensina protocolos de ministração de quimioterapia e radioterapias. As abordagens de imunoterapia que estão surgindo aos poucos na cultura e prática médica, bem como algumas inovações , mesmo que  ainda vigore a política de  remédios , tem rompido os paradigmas da quimioterapia, cirurgias e radioterapias agressivas. 

Primeiro estudo é de 2005 , o que demonstra que as declarações  dos oncologistas nas entrevistas do programa do "conexão repórter" estão no mínimo com 12 anos de atraso em termos de atualização do conhecimento em câncer .

Ornish D, Weidner G, Fair WR, Marlin R, Pettengill EB, Raisin CJ, Dunn-Emke S, Crutchfield L, Jacobs FN, Barnard RJ, Aronson WJ, McCormac P, McKnight DJ, Fein JD, Dnistrian AM, Weinstein J, Ngo TH, Mendell NR, Carroll PR. Intensive lifestyle changes may affect the progression of prostate cancer. J. Urol. 2005 September;174(3):1065-1069.

http://www.cam-cancer.org/The-Summaries/Dietary-approaches/Ornish-diet-and-lifestyle-modification-programme/Does-it-work

Testes clínicos

A dieta de Ornish e o programa de modificação do estilo de vida foram testados em um estudo randomizado em 93 homens com câncer de próstata precoce com biópsia (PSA 4-10 ng / ml, escores de Gleason menores que 7) que optaram por não se submeter a nenhum tratamento convencional 3. Após 1 ano, as mudanças intensivas no estilo de vida resultaram em uma diminuição de PSA de 4% e uma inibição do crescimento estimulado pelo soro de células LNCaP de 70%, em comparação com um aumento de 6% do PSA e apenas 9% de inibição do crescimento LNCaP no grupo controle (não seguindo a dieta de Ornish e o programa de modificação do estilo de vida, mas fazendo mudanças de estilo de vida conforme o recomendado pelo médico). Nenhum dos 44 pacientes no grupo de tratamento, mas 6 dos 49 pacientes com controle tiveram de sofrer tratamento convencional (p. Ex., Prostatectomia radical, radioterapia ou terapia de privação de andrógenos) devido a aumento do PSA e / ou progressão da doença na ressonância magnética imagem. Após 2 anos, 2 dos 43 pacientes experimentais e 13 dos 49 pacientes com controle sofreram tratamento convencional com câncer de próstata;10 . Os pacientes experimentais apresentaram melhorias maiores nos parâmetros de saúde cardiovascular do que os pacientes controle. Os pacientes do grupo de tratamento pareciam experimentar otimismo geral e esperança, ganhar ganhos em sua disponibilidade emocional e valorizar uma experiência de comunidade entre colegas

Ornish
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11295627
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18602144
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16094059
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16413347

Richard Belivéau - Mais de 100 artigos ligados a alimentação e câncer 
http://sodregoncalves.no.comunidades.net/cancer-bibliografia

http://sodregoncalves.no.comunidades.net/pagina-sem-titulo3



COMPARAÇÃO COM SOFTWARES DIAGNÓSTICO MAIS PRECISO 

Lexi-Interact  
Micromedex Drug Interactions 
iFacts
Medscape
Epocrates

Segundo pesquisa publicada na journal of research in pharmacy practice (jrpp), uma comparação entre estes 5 programas deu o seguinte resultado: 

MEDSCAPE  IBM WATSON

"Em um trabalho recente, o supercomputador mostrou acelerar significativamente o processo de análise do sequenciamento de todo o genoma, que é o "prinicipal gargalo na genômica do câncer". O IBM Watsondemorou 10 minutos para chegar a conclusões semelhantes às tiradas por uma equipe de especialistas após 160 horas de análise; No entanto, quando implementado na prática oncológica na vida real, o Watson se sai menos bem, de acordo com o dossiê da STAT. Parte do problema parece resultar de como o sistema foi alimentado. Os documentos internos da IBM põem grande parte da responsabilidade nos problemas no alimentação do Watson pelos engenheiros da IBM e os oncologistas do Memorial Sloan Kettering Cancer Center em Nova York, que foram designados para alimentar o Watson em 2012. O programa resultante aprendeu um pequeno número de casos "sintéticos" de câncer, ou pacientes hipotéticos, em vez de dados reais dos pacientes. Assim, Watson foi treinado de acordo com a experiência de alguns especialistas para cada tipo de câncer, em vez de ser alimentado com diretrizes ou evidências. A STAT também observou que as informações do produto postadas no site da IBM indicam que o Watson continua a ser alimentado usando dados reais de pacientes e diz que o supercomputador "analisa dados de pacientes contra milhares de casos históricos e conhecimentos adquiridos de milhares de horas de análises e análises do Sloan Kettering". No entanto, o número de casos de cada um dos oito tipos de câncer cobertos é uma pequena fração do total geral, que varia de 106 casos de câncer de ovário até 635 casos de câncer de pulmão.". https://www.medscape.com/medicalstudents

FASE CLÍNICA

Parece existir no Brasil um esforço em priorizar soluções desenvolvidas aqui segundo demandas do SUS http://www.cff.org.br/noticia.php?id=1923

http://www.igeim.org.br/

http://wikimapia.org/36066318/pt/UPECLIN-Unidade-de-Pesquisa-Cl%C3%ADnica-da-Faculdade-de-Medicina-de-Botucatu-UNESP

https://exame.abril.com.br/brasil/regulacao-custos-e-burocracia-travam-pesquisas-na-area-da-saude/